二十镇水师被缩编为四个海军舰队和一个内河舰队，四个海军舰队分别为东海舰队、南海舰队、西海舰队和北海舰队，内河舰队的名称经过多次讨论，被命名为内河第一舰队。其中南海舰队驻扎南澳、铜山两岛，东海舰队驻扎福州港，西海舰队暂驻厦门港，北海舰队驻福宁府的烽火门水寨。内河舰队暂驻闽清县。四大舰队各辖各式战船一百五十四艘，合计七百七十艘战船，内河舰队多为两百料以下的小型战船，数量高达三百二十七艘，仅仅从人数上来将，是五大舰队排名第一的。

四大舰队官兵人数，每只舰队人数七千三百人，四大舰队合计两万九千人，内河舰队人数一万零七百人，海军人数合计高达三万九千七百人。

整编过后，郑家军海陆两军人数高达十万五千人，这么庞大的兵力，在整个长江以南，都是首屈一指的庞大兵力。

整编会议结束后，刚刚成立的海军部、陆军部、兵官、户官就进入了超级忙碌的状态，开始了部队的整编工作。

郑锦反而有些清闲下来，通过暗队、金队等情报机构盯着整编的情况，在没有军中大佬支持的镇将，不敢在整编会议上提出意见，在回到队伍中，开始搞一些小动作，有点不太想失去手中的权力。

尤其是陆军之中，七十二个兵镇被整编为五个军镇，虽然有些兵镇的人数不过五六百人，但在职级上跟上千人的兵镇是平级的，现在整编之后，变成了营官或者标领，归协领、镇将管理，这头上就多了几个婆婆，心中肯定是有些不满的。但又不敢提出明确的反对意见，只能私下偷偷的给整编工作挖一些小坑，使一些绊子，让整编工作，也充满了一些小变动。

这些情况的发生，也让郑锦有些苦恼，处理或不处理都不好，整编期间，原本就有些军心动荡，若是在有些波折，肯定会引起一些不必要的情况。

后来，觉得不耐烦的郑锦干脆直截了当地一刀切，除了留守防备清军的军队不动外，其余的所有镇将、副将全部拉到福州海陆学院，进行第一期为期三个月的高级军事班。避免这些镇将在出一些幺蛾子，要是惹出什么乱子出来，无论是处理或不处理，都是不太好的情况。

于是乎，刚刚才回到驻地没有多久的各地镇将、副将又被紧急召回到福州进行所谓的高级军事班学习，学习新式的战略、战术。

这样的情况，也让一些镇将有些怨言，还有一些心虚的镇将根本不敢多说什么，唯恐被世子拉去当做典型。他们的头头可都跟他们反复强调了，若是被世子抓住了把柄，他们可不会舍了老脸去求世子网开一面。