小杰冲到时空扭曲装置的面前，看着眼前的六台装置，看着被关押的时空宝可梦幼崽，眼中闪过一丝坚定。他伸出手，凝聚起体内所有的龙系能量，朝着装置的核心狠狠砸去。“轰！”龙系能量击中装置核心，装置剧烈震颤，核心的黑色光芒瞬间黯淡下来，混沌能量的输出也变得缓慢起来。但仅仅过了几秒，装置核心的黑色光芒再次亮起，混沌能量的输出又恢复了原样——原来，六台装置相互连接，形成了一个阵法，仅仅破坏一台装置，根本无法阻止整个装置的运转。
“不好，必须破坏所有的装置，才能彻底停止运转！”小杰心中一紧，立刻转身，朝着另一台时空扭曲装置冲去。就在这时，赤日摆脱了希罗娜的牵制，朝着小杰冲来，手中的混沌能量狠狠砸向小杰的后背：“小杰，你别想破坏装置！”
“小心！”希罗娜大喊一声，立刻指挥烈咬陆鲨，喷出一道金色的龙息，朝着赤日射去。赤日无奈，只能转身躲闪，龙息击中时空扭曲装置的一侧，装置再次震颤，核心的黑色光芒又黯淡了几分。小杰趁机冲到另一台装置面前，再次凝聚龙系能量，砸向装置核心，装置的运转速度再次变慢。
空中，帝牙卢卡与帕路奇犽，因为混沌能量的输出变慢，狂暴的气息也微微减弱了几分，攻击的频率也降低了。裂空和沧澜趁机恢复了一些能量，再次释放出龙息和水流环，重新构建起临时屏障，阻挡时空乱流的扩散，为小杰和希罗娜争取更多的时间。焰心也趁机带领民众，加快了撤离的速度，越来越多的民众，成功撤离到了安全区域。
凌玥派来送混沌能量干扰器的人，也终于抵达了时空广场的外围，他们避开混沌宝可梦的攻击，朝着小杰的方向跑来，手中紧紧攥着升级后的混沌能量干扰器。“小杰，干扰器来了！”一名联盟训练家大喊一声，将干扰器朝着小杰扔去。
小杰接住干扰器，心中一喜，立刻按下干扰器的按钮。干扰器释放出一道蓝色的能量波，瞬间扩散开来，覆盖了整个时空广场，时空扭曲装置的运转速度瞬间变慢，核心的黑色光芒彻底黯淡下来，混沌能量的输出也随之停止；空中的帝牙卢卡与帕路奇犽，受到干扰器的影响，周身的混沌能量波动变得紊乱起来，狂暴的气息渐渐减弱，眼神中闪过一丝迷茫，仿佛在挣扎着恢复理智。
“有效！干扰器起作用了！”希罗娜脸上露出一丝欣慰的笑容，加大对赤日的攻击力度，金色的龙息狠狠击中赤日的身体，赤日被震得连连后退，嘴角渗出黑色的血液，周身的混沌能量波动变得紊乱起来。
赤日看着眼前的景象，脸上露出一丝绝望，他疯狂地大喊：“不！不可能！虚空之主的计划，怎么可能失败！”他再次调动体内最后的混沌能量，朝着时空扭曲装置冲去，想要重新启动装置，“我一定要启动装置，重塑世界，哪怕付出一切代价！”
“休想！”小杰厉声喝道，拿着混沌能量干扰器，朝着赤日冲去，干扰器释放的蓝色能量波，再次击中赤日，赤日体内的混沌能量瞬间紊乱，再也无法凝聚起力量，倒在地上，浑身抽搐，眼神中的疯狂渐渐褪去，恢复了一丝清醒，却依旧虚弱不堪。
小杰没有理会赤日，转身朝着剩余的时空扭曲装置冲去，一边用干扰器压制混沌能量，一边用龙系能量，逐一破坏装置。“轰！轰！轰！”一台台时空扭曲装置被破坏，核心的黑色光芒彻底熄灭，能量管道也随之断裂，被关押在容器中的时空宝可梦幼崽，终于摆脱了能量抽取的痛苦，发出微弱的呜咽声，眼神中闪过一丝感激。
随着最后一台时空扭曲装置被破坏，时空扭曲场的黑色漩涡渐渐消散，地面的黑色纹路也开始慢慢褪去，时空磁场的波动渐渐恢复平稳，时空乱流也随之消失，那些浮现的时空裂缝，也在慢慢闭合。空中的帝牙卢卡与帕路奇犽，周身的混沌能量被干扰器彻底压制，眼神中的迷茫越来越浓，狂暴的气息渐渐消失，身体开始微微颤抖，仿佛在挣扎着摆脱混沌能量的残留影响，恢复清醒。
小主，
希罗娜走到赤日的身边，看着虚弱不堪的赤日，眼中没有了愤怒，只剩下一丝惋惜：“赤日，你被虚空之主操控，犯下了不可饶恕的错误，但你最终恢复了清醒，希望你能为自己的行为，付出应有的代价。”赤日看着希罗娜，眼中满是愧疚与悔恨，轻轻点了点头，没有说话，任由希罗娜将他制服。
小杰走到容器面前，小心翼翼地打开容器，将里面的时空宝可梦幼崽抱了出来。这些幼崽浑身虚弱，气息微弱，小杰轻轻抚摸着它们的身体，释放出龙系能量，一点点滋养着它们的身体，帮助它们恢复生命力。“别怕，一切都结束了，我会保护你们的。”小杰轻声说道，眼神温柔而坚定。
空中的帝牙卢卡与帕路奇犽，终于摆脱了混沌能量的残留影响，恢复了清醒。它们看着下方的时空广场，看着被破坏的时空扭曲装置，看着被解救的时空宝可梦幼崽，眼中满是愧疚与自责，发出一声低沉的呜咽，缓缓降落下来，来到小杰和希罗娜的面前，微微低下头，仿佛在为自己失控时的破坏行为道歉。
“帝牙卢卡，帕路奇犽，你们不用自责。”希罗娜轻声说道，眼神温柔，“这不是你们的错，是赤日和虚空之主，用混沌能量操控了你们，你们依旧是守护时空秩序的神圣传说宝可梦。”帝牙卢卡和帕路奇犽轻轻点了点头，周身的时间能量与空间能量，渐渐变得柔和起来，开始修复被破坏的时空之塔和周边的区域，倒塌的墙体被重新修复，断裂的树木重新生长，被时空乱流吞噬的物体，也渐渐恢复了原样，仿佛一切都没有发生过一般。
裂空、沧澜、焰心和糯糯，也纷纷来到小杰的身边，它们浑身是伤，气息紊乱，却依旧眼神坚定，脸上满是疲惫后的欣慰。小杰摸了摸它们的脑袋，眼中满是感激：“谢谢你们，伙伴们，没有你们，我们就无法阻止这场危机，你们辛苦了。”
凌玥也赶到了时空广场，看着眼前的景象，脸上露出一丝欣慰的笑容，眼中的泪水忍不住流了下来：“太好了，我们成功了，时空危机解除了！”她走到小杰和希罗娜的身边，递过几瓶恢复药剂：“这是恢复药剂，给宝可梦们用上，它们都受伤了。”
小杰和希罗娜接过恢复药剂，给受伤的宝可梦们用上，宝可梦们的气息渐渐恢复，身上的伤口也在慢慢愈合。联盟训练家们和疏散的民众，也纷纷来到时空广场，看着恢复平静的时空之塔，看着帝牙卢卡与帕路奇犽修复世界的身影，脸上满是欣慰与庆幸，欢呼声、掌声，交织在一起，响彻整个时空广场。
但小杰知道，危机并没有彻底解除。虚空之主的意识，只是暂时被压制，并没有被彻底击溃，它依旧潜伏在某个角落，等待着卷土重来的机会；被混沌能量感染的宝可梦，还有很多没有被净化；时空秩序虽然暂时恢复，但依旧脆弱，需要进一步修复。他抬头望向天空，眼神坚定，心中暗暗发誓：无论虚空之主什么时候卷土重来，我都会带领伙伴们，与希罗娜冠军、联盟训练家们一起，守护好神奥地区，守护好时空秩序，绝不允许这样的危机，再次发生。
帝牙卢卡与帕路奇犽，修复完周边的区域后，来到小杰和希罗娜的面前，发出一声威严的龙吟，仿佛在传递着承诺——它们会继续守护神奥地区的时空秩序，警惕虚空之主的再次入侵。随后，它们转身，朝着沉睡之地飞去，继续沉睡，维系着时空的平衡，却也随时准备着，在时空秩序再次遭到破坏时，苏醒过来，并肩作战。
赤日被联盟训练家们带走，等待着他的，将是神奥联盟的审判；被混沌能量感染的宝可梦，在小杰、希罗娜和凌玥的努力下，渐渐被净化，恢复了正常；疏散的民众，也纷纷回到了自己的家园，开始重建被破坏的家园；时空之塔，在帝牙卢卡与帕路奇犽的修复下，重新恢复了往日的庄严与神圣，只是墙体上，还残留着些许战斗的痕迹，时刻提醒着人们，这场惊心动魄的时空危机，以及所有人为守护家园，所付出的努力。
夕阳缓缓升起，金色的阳光洒在时空之塔上，驱散了残留的混沌气息，照亮了这片历经磨难的土地。小杰站在时空广场上，身边是他的伙伴们，远处是希罗娜和联盟训练家们忙碌的身影，空气中，不再有混沌的气息，只剩下和平与安宁。但小杰的眼神依旧坚定，他知道，这只是一场暂时的胜利，虚空之主的威胁依旧存在，后续的道路，依旧充满了挑战，但他无所畏惧，因为他有伙伴们的陪伴，有希罗娜的支持，有所有守护神奥地区的人的力量，他会一直坚守下去，守护好这片他热爱的土地，守护好时空的秩序，等待着最终决战的到来。